由于双方都被逼到了生死关头，科特兹将军和斯拉维克将军分别代表GDI和Nod达成了这对原本不共戴天的仇敌之间的临时协议，停火。彻底铲除CABAL是现在的第一要务，为了粉碎CABAL的数据核心，他们制订了一个两步走的合作计划。

CABAL的最终基地在东非某处，旁边有两个异常巨大的支援基地，分别负责收集这里丰富的泰矿资源和制造生化机器大军。GDI技术人员改编了一个捕获来的生化机械兵的程序，让它听命于GDI并携带了电子病毒。“火风暴”特遣部队受命暗中把该生化兵送入CABAL的主要生产基地，一举瓦解掉CABAL的兵力来源。同时斯拉维克的部队在另外一个方向击破了CABAL的全部采矿基地，切断了它的经济。

极大弱化了CABAL主基地的枝节之后，GDI和Nod乘势推进双面夹击CABAL主核，GDI方面由“火风暴”部队承担此次任务，而伤亡惨重的Nod为了鼓舞士气则派出了全体精锐军官为战斗打头阵。双方进度良好，在留下了方圆几十公里地面上无数机器人残骸后，两军杀到了CABAL主核门前。然而在这里他们遇到了一生中最大的噩梦，包括威力提升数倍的黑暗方尖塔，以及同时结合了Nod生化机械人科技和GDI机甲科技的终极杀戮武器——百米高的战斗机器人“核心守卫者”。GDI和Nod的部队一个接一个如砍瓜切菜般被巨大的黑暗激光撕碎，结果它们几乎打光了所有炮弹，包括多弹头导弹和卫星离子炮，才终于把核心守卫者打回成一堆烂铁，剩下的CABAL主核也就小菜一碟了。CABAL就如同之前的凯恩一样兵败身亡……或许吧。