世界人民对于萨拉热窝战事结束的反应十分矛盾。很显然有一批国际政治家并不相信有人能真正阻止凯恩，其中更不乏有人与兄弟会的成员串通一气，为了自己在凯恩构筑的新的时代和文明中保留一席之地。然而所有政治领袖都亲眼目睹过了Nod兄弟会的侵略性和野蛮性，同时也认识到了全球主动防御组织为了争取这次胜利而付出的不菲代价，因此GDI的官兵被誉为

[center]“人类历史上的英雄们”[/center]

随着GDI的部队开始对Nod神殿的废墟进行清理的时候，他们对许多建筑的设计结构感到迷惑不解，同时完全找不到凯恩的遗体部分也令他们无法安心。由于兄弟会在建造神殿和基地时使用了一种奇特的建造工艺，其建筑图纸和一些器具都被全球各大博物馆收藏展出。接下去的搜捕对象就是对凯恩保持死忠的兄弟会残余人员。

在搜寻能证实凯恩已经死亡的线索的同时，GDI的军事科研工作者开始着手对新开发的武器进行测试并对现有的装备进行更新和升级。GDI认为他们必须为下一场战争做好准备，无论敌人是Nod兄弟会或者其他敌对势力。

大战结束之后，Nod兄弟会开始化整为零，分散成了无数小派系直至统一的Nod一去不复返。残存的Nod士兵和指挥官的行动转向了地下，从大众视野中消失了。被逮捕的Nod指挥官都被送上了国际法庭接受了审判，因犯有战争屠杀罪行的人多被判处了死刑，另外一些精神错乱的狂热者被处以无期徒刑并将在精神病院中度过余生。尽管Nod兄弟会被击败了，但是GDI在联合国的命令下继续进行着新科技的研究和开发，以确保不会再像当初那样被凯恩打得措手不及。

然而，不久之后，GDI的手头除了Nod兄弟会和新科技研发之外又多了一重心病。就在GDI指挥官试图集中精力彻底消灭兄弟会的时候，他们发现在大战当中为他们提供了资金支持和科技革新，并以此来击败凯恩的关键物质开始成为了危及世界安全的头号敌人，这就是——泰伯利亚矿。

泰伯利亚矿的生长开始逐渐严重影响到了地球的生态系统，联合国紧急正式命令GDI立即开始着手研究如何阻止它的生长，并开始从受泰矿严重影响的区域疏散群众。

“泰伯利亚矿的可能性是……无限的。”
[center]——莫比乌斯博士 在科技节目上的讲话[/center]